苯扎氯銨是一種陽離子表面活性劑，屬非氧化性殺菌劑，具有廣譜、高效的殺菌滅藻能力，能有效地控制水中菌藻繁殖和粘泥生長，并具有良好的粘泥剝離作用和一定的分散、滲透作用，同時具有一定的去油、除臭能力和緩蝕作用。苯扎氯銨毒性小，無積累性毒性，并易溶于Chemicalbook水，并不受水硬度影響，因此廣泛應用于石油、化工、電力、紡織等行業的循環冷卻水系統中，用以控制循環冷卻水系統菌藻滋生，對殺滅硫酸鹽還原菌有特效。苯扎氯銨可作為紡織印染行業的殺菌防霉劑及柔軟劑、抗靜電劑、乳化劑、調理劑等，也可作為濕巾防腐殺菌劑。